En versiones anteriores a Configuration Manager 2012 SP1, existe un tiempo aleatorio de despliegue de actualizaciones que puede llegar a ser de hasta dos horas, como se muestra en el siguiente enlace:
http://technet.microsoft.com/en-us/library/bb694223.aspx
Microsoft introdujo esta característica como medida de protección para evitar colapsar la infraestructura y que todos los clientes instalasen las actualizaciones que les correspondiesen justo al llegar al deadline.
En versiones 2012 SP1 y posteriores, es posible deshabilitar este comportamiento (de hecho, viene deshabilitado por defecto) así como configurarlo, usando los client settings como se muestra en la siguiente figura:
Sin embargo, para versiones anteriores es necesario recurrir al scripting. A continuación os dejo un script que permite dicha configuración:
http://gallery.technet.microsoft.com/scriptcenter/How-to-Disable-the-c3b29b29
